如何在高斯view中找到过渡态(高斯软件在做计算的时候是怎样工作的?)

案例 2019-12-07 23:04:23

高斯optcyc和scfcyc的区别
optcyc=500,scfcyc=500 这是一个办法。 另外一个,你打开log文件看到最后一步的结构是否合理。 有时候高斯优化会优化成不合理的结构。
高斯09找过渡态的关键是什么,用高斯View05 作图
Gaussian09优化过渡态需要的初始构型是根据你设计的反应途径猜测的。如果你需要得到 “甲基自由基与臭氧的反应” 的过渡态,你设计的反应是甲基夺取臭氧中的一个氧原子,还是甲基结合到臭氧上,这两个途径的过渡态是不同的。
如果你希望甲基夺取臭氧上的一个氧原子,你需要将被夺取的氧原子与甲基的碳原子接近,同时让这个被夺取的氧原子远离原臭氧的结构。也就是说,一个氧原子处于甲基和氧分子之间。
H3C....O....O2 大概是这个样子吧,原子间的距离需要多调试几次。
先用 MP2/6-31G(d) opt(ts,calcfc,maxcyc=200,nosymm) freq=noraman 试试。

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高斯软件在做计算的时候是怎样工作的?
高斯不能优化轨道,只能计算波函数(轨道)和优化构型。

高斯计算某个分子构型的波函数和能量的基本方法是自洽场方法(SCF),就是用迭代的办法解由薛定谔方程变化得到的Hartree-Fock-Roothaan方程得到分子的波函数和能量,如果使用密度泛函理论,则解Kohn-Sham方程。针对不同的需要,还有用于计算组态相关的MCSCF,适用于溶剂模型的SCRF等等,它们都是基于SCF方法,基本原理相同,都是用迭代方法。

优化构型以一定的算法搜索一系列构型,并且每一步都计算能量和梯度,最终达到能量极小点(稳定构型)或者极大点(过渡态或者高阶鞍点)。高斯主要使用本征值跟踪算法(EF)和内坐标的Berny算法等做优化。